Cinayetin üzerinden 47 yıl geçmesine rağmen olayın tüm yönleriyle aydınlatılamaması, dosyayı Türkiye'nin en karanlık siyasi cinayetlerinden biri olarak gündemde tutuyor.
Cinayetin faili olarak yakalanan Mehmet Ali Ağca, kısa süre sonra cezaevinden firar etmiş, yurt dışına kaçmış ve daha sonra Papa suikastı girişimiyle uluslararası bir figür haline gelmişti. Yıllar içinde Türkiye'ye iade edilen Ağca, çeşitli yargı süreçlerinin ardından serbest bırakıldı. Cinayete karışan diğer isimler de etkili cezalar almadan serbest kaldı.
İpekçi'nin kızı Nükhet İpekçi, yıllardır adalet mücadelesi verdiklerini belirterek, "Babam ölmedi, öldürüldü. Asıl ihtiyaç duyduğumuz şey, hakikatin devlet tarafından resmî olarak açıklanmasıdır" dedi. Nükhet İpekçi, cinayetin arka planında devlet içindeki karanlık yapılarla bağlantılı bir organizasyon bulunduğuna dair güçlü bulgular olduğunu vurguladı.
Susurluk skandalı ve benzeri gelişmelere rağmen, İpekçi cinayetinin perde arkası tam olarak ortaya çıkarılamadı. Dosya, Türkiye'de cezasızlık tartışmalarının ve devlet-hukuk ilişkilerinin sembol olaylarından biri olmayı sürdürüyor.